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水产和渔业
> 脊椎动物 Orexin 前体蛋白的进化树分析
脊椎动物 Orexin 前体蛋白的进化树分析
图片来源:
陈文波,王鑫,周雅璐,董海燕,林浩然,李文笙.
尼罗罗非鱼Orexin前体基因的克隆、组织分布及其在摄食调控中的表达 ,
动物学研究, 2011 (03).
>>查看本文图片摘要
图片关键词:
软件图
同源性分析
进化树
前体蛋白
脊椎动物
尼罗罗非鱼
所属学科:
水产和渔业
图片上下文:
的同源性最高为 78.6%, 与其他物种的同源性则在53.6%~75%之间。进一步应用 Mega 3.1 软件构建Orexin 前体蛋白系统进化树(图 3)。由进化树可见,Orexin 前体蛋白共分为两大支, 尼罗罗非鱼 Orexin前体蛋白位于硬骨鱼类这一分支上, 且与青锵、河
....
豚、大西洋鳕鱼的关系较近; 与鲤形目(斑马鱼和金鱼)关系次之; 与哺乳动物的关系最远。这与同源性分析的结果相一致。2.2 尼罗罗非鱼 Orexin 前体基因的组织表达运用 Real-time PCR 分别检测尼罗罗非鱼Orexin 前体基因在 18 个组织中的表达量, 结果显示,尼罗罗非鱼 Orexin 前体基因分布广泛, 在 18 种组图 3 脊椎动物 Orexin 前体蛋白的进化树分析Fig. 3 Phylogenetic tree based upon the alignment of aminoacid sequences of vertebrates prepro-orexins采用 Mega3.1 软件(Neighbor-Joining 法)构建。图中各分支数值:置信度(%);▲:尼罗罗非鱼 Orexin 前体蛋白。Phylogenetic tree was constructed by Mega 3.1, and the numbershown at each branch indicates the boots
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