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> 基于ITS1-5.8s-ITS2序列的系统学分析
基于ITS1-5.8s-ITS2序列的系统学分析
图片来源:
张传博,王艳丽,易萌,董德成,苏晓庆.
江苏省天王镇磨盘山金蝉花分离菌株鉴定及系统发育分析 ,
广东农业科学, 2013 (15).
>>查看本文图片摘要
图片关键词:
序列
菌株
下垂虫草
Bootstrap法
蝉花
蝉拟青霉
分析分离
沙氏培养基
序列相似
自展
所属学科:
农作物
图片上下文:
在沙氏培养基上分生孢子多呈卵形,两端尖(图2,封底)。2.4蝉花分离体的分子系统学分析分离菌株JSJR01的ITS区序列和双节棍孢子植生虫草(Phytocordycepsninchukispora)BCC13914菌株,大蝉草(Cordycepscicadae)4644、4646
....
菌株,OphiocordycepssoboliferaJZB2115037,蝉棒束孢菌(Isariacicadae)MRCIF8、MRCIF45、MRCIF4等菌株的相似度均为98%~99%;和下垂虫草(Cordycepsnutans)序列相似度为97%。结合Genebank上的14个虫草有关序列进行了系统发育树构建,分枝统计支持率评估采用Bootstrap法,自展值为1000。由图3可知,所有序列形成2个大的分支,菌株JSJR01和大蝉草(Cordycepscicadae)4646菌株,蝉棒束孢菌(Isariacicadae)BCC19486、MRCIF8,蝉拟青霉(Paecilomycescicadae)BA-001菌株,炭角棒束孢(Isariaxylariiformis)图3基于ITS1-5.8s-ITS2序列的系统学分析153
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