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> GhGDSL与拟南芥GDSL脂肪酶聚类分析
GhGDSL与拟南芥GDSL脂肪酶聚类分析
图片来源:
佟祥超,王丽曼,胡文静,张雪颖,张天真,郭旺珍.
一个棉花GDSL脂肪酶基因的克隆与功能分析 ,
作物学报, 2013 (07).
>>查看本文图片摘要
图片关键词:
序列
拟南芥
脂肪酶
聚类分析
脂肪酶基因
所属学科:
农作物
图片上下文:
治?为了进一步了解新发现的GhGDSL基因的系统进化分类,从TAIR(http://www.arabidopsis.org/in-dex.jsp/)上下载拟南芥107个GDSL脂肪酶基因序列,用MEGA5与GhGDSL基因序列构建系统发生树(图1),使用Neighbor-Jion
....
ing法,其中BootStrap值为1000。根据序列的同源性将进化分析结果分成3组(GroupI~III),GhGDSL与拟南芥GDSL基因家族中的GroupIII同源性最高,其中相似度最高的是AT2G36325.1和AT3G09930.1(NP_187604.1)。拟南芥GroupIII中大部分基因的功能与种子油脂代谢有关[17],推测GhGDSL在种子油脂代谢过程中发挥作用。图1GhGDSL与拟南芥GDSL脂肪酶聚类分析Fig.1PhylogeneticanalysisofGhGDSLandGDSLlipasessubfamilyinArabidopsis107个拟南芥GDSL脂肪酶基因序列从TAIR(http://www.arabidopsis.org/index.jsp/)网站下载。Subfamilyof107GDSLlipaseswasdownloadedfromTAIR(http://www.arabidopsis.org/index.jsp/).
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