| 文献标题： |
大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达 |
| 文献来源： |
郑炜君;徐兆师;冯志娟;李连城;陈明;柴守诚;马有志; 作物学报 2012年 09期 |
| 文献关键词： |
NF-YB家族全基因组鉴定进化差异表达启动子 |
| 文献摘要： |
利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大豆NF-YB家族基因的全序列、定位和拷贝数,通过序列比对进行进化和分类分析。利用大豆高通量RNA测序数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析。结果表明,大豆基因组中含有28个NF-YB家族基因,分布于大豆的14条染色体上,系统进化树分析将其分成3类。启动子分析表明,几乎全部NF-YB家族基因的启动子区均含有逆境应答反应顺式作用元件。各个发育阶段中,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有2个在根瘤中特异表达,2个在根中特异表达,2个在根瘤中优势表达,另外4个在其他部位优势表达。研究结果促进了NF-YB家族基因的功能研究与利用。 |